农村医疗合作保险在手机上可以通过以下步骤进行缴纳：
打开微信：
在手机上打开微信应用，并确保已经登录自己的账号。进入支付页面：
点击右下角的“我”，然后在页面中找到并点击“支付”选项。选择生活缴费：
在支付页面中，找到腾讯服务栏，点击“生活缴费”。此时，微信可能会请求获取你的位置信息，以便为你提供更准确的缴费服务，点击允许即可。选择社保医保：
在生活缴费页面中，找到并点击“社保医保”选项。输入缴费信息：
选择你要缴费的项目，然后按照提示正确输入缴费编号。同时，确保在“我已阅读并同意《微信支付生活缴费服务协议》”前面打对勾。确认并缴费：
确认缴费编号无误后，点击“立即缴费”。按照页面提示完成支付流程，当显示缴费成功后，即表示农村医疗合作保险的缴纳已经完成。请注意，以上步骤可能因微信版本或地区差异而略有不同，但总体流程大致相同。在缴费过程中，如有任何疑问或遇到问题，可以联系当地社保部门或微信客服进行咨询。