法律分析：事业单位合同制与编制制的差异主要体现在以下几个方面：
1. 招聘方式的区别：
- 合同工：通过人事部门发布招聘信息，经过面试等流程后，与单位签订劳动合同，建立劳动关系。
- 编制工：通过公务员考试、事业单位招聘考试或军队军官转业安置等途径获得职位。
2. 工作权限的差异：
- 合同工：通常负责协助执法工作，不具备直接的执法权。
- 编制工：拥有执法权，能够指挥合同工进行执法协助。
3. 福利待遇的差异：
- 合同工：工资通常来自单位内部经费，相对较低；需个人缴纳养老保险，退休金根据个人缴费情况确定。
- 编制工：工资来源于国家财政保障，较为稳定且工资水平较高；不需要缴纳养老保险，退休金根据职级确定。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应如实告知劳动者工作相关情况。同时，用人单位与劳动者应当订立书面劳动合同。劳动关系自用工之日起建立。